安徽省立医院南区坚持“大专科、小综合”的发展战略,拥有安徽省立医院整体搬入的神经外科、神经内科、心脏外科、心血管内科等优势学科以及挂靠安徽省立医院的安徽省脑立体定向神经外科研究所、安徽省心血管病研究所等学术研究机构。
神经外科为国家临床重点专科、安徽省临床医学重点学科,心脏外科和心血管内科为安徽省临床医学重点学科。神经外科开展的脑立体定向技术综合研究及神经导航技术在全国属领先地位;心脏外科心脏移植、心肺联合移植技术进入国内先进行列;心血管内科年介入治疗数省内领先。
安徽省立医院南区拥有包括国内首台飞利浦双向平板多功能数字成像血管造影机(DSA),目前世界上最先进的64排螺旋CT、3.0T核磁共振成像系统等30多套的大型诊疗设备。同时,引进了临床电子病历系统(CIS)、医院管理系统(HIS)和医学影像存储和传输管理系统(PACS),为无胶片和无纸张的数字化医院奠定了基础。